空间结构被破坏的蛋白质，仍存在肽键，所以能与双缩脲试剂发生紫色反应；若用紫色洋葱鳞片叶内表皮细胞面容线粒体，可使用蒸馏水配制健那绿溶液；溴麝香草酚蓝水溶液的颜色变化可检查二氧化碳是否生产，而酵母菌的有氧呼吸和无氧呼吸都能产生二氧化碳，只是量不同；甲基绿染液可检查DNA的分布，醋酸洋红或龙胆紫可用于观察根尖分生组织的有丝分裂。